Kaksi y-haploryhmää

[Tiina Lietzén]

Hei
Olen aika lailla pihalla näistä haploryhmistä, mutta olen jotenkin päässyt käsitykseen, että yhdellä henkilöllä voi olla vain yksi y-haploryhmä.


Eilen huomasin, että isoisälleni oli Geniin ilmestynyt kaksi y-haploryhmää. Onko joku siis tehnyt jossain jonkun virheen ja lisännyt myös virheellisen haploryhmän isoisälleni vai onko tämä mahdollista?



Olen seurannut "syyllisiä" ja näyttävät olevansa suunnilleen toistensa 3. serkkuja ja molemmilla suora isälinja isoisääni eli ymmärrykseni mukaan heillä kai pitäisi olla sama y-haploryhmä... vai?



:confused:


Tiina

[Juha]

Genissä nyt voi olla mitä vaan, mutta onko perushaplo sama?

Juha

[Tiina Lietzén]

Nämä ovat N-CTS9... ja N-Y143... Ekassa testinä Y-67, jälkimmäisessä Y-111.



Tiina

[Juha]

eli sama perushaplo. toinen on vain tarkempi testi

mä en näkis tossa mitään ongelmaa, mutta kommentoikaas Jaska ym


t. Juha

[Tiina Lietzén]

Kiitos.



Tiina

[Jaska]

Eilen huomasin, että isoisälleni oli Geniin ilmestynyt kaksi y-haploryhmää. Onko joku siis tehnyt jossain jonkun virheen ja lisännyt myös virheellisen haploryhmän isoisälleni vai onko tämä mahdollista?

Olen seurannut "syyllisiä" ja näyttävät olevansa suunnilleen toistensa 3. serkkuja ja molemmilla suora isälinja isoisääni eli ymmärrykseni mukaan heillä kai pitäisi olla sama y-haploryhmä... vai?

Nämä ovat N-CTS9... ja N-Y143... Ekassa testinä Y-67, jälkimmäisessä Y-111.

Y67 ja Y111 eivät itsessään tuota muuta haploryhmätulosta kuin N-M231, joka siis on N-haploryhmän juuritulos: ikivanha mutaatio, jonka jälkeen jokaisella on tapahtunut monia, monia mutaatioita. Niiden testaamisesta vain joutuu maksamaan erikseen.

Joko nuo alahaploryhmät on saatu yksittäinen SNP testaamalla tai sitten BigY-testillä. Luultavasti vain toisella on BigY ja toinen on testannut yksittäisen SNP:n. Tosin on sekin mahdollista, että toisen isälinjassa on tapahtunut mutaatio(ita) yhteisen esi-isän jälkeen, jolloin tuo latvimmainen eli terminaalimutaatio on eri vaikka molemmilla olisi BigY tehtynä.

Oletan, että nuo alahaploryhmät ovat peräkkäisiä eli lähellä toisiaan, vaikket antanutkaan niitä kokonaan. Jos taas ne ovat ihan eri päissä N-haploryhmän sukupuuta, niin sitten kyseessä täytyy olla jompikumpi seuraavista:

1. Virhe sukututkimuksessa, eli on sekoitettu esim. kaksi samannimistä henkilöä Genin sukupuussa.
2. "Salasiitos", eli jommankumman isälinjassa joku paperi-isä ei ollutkaan biologinen isä.

[JaskaS]

Voinen paljastaa etäsukulaiseni puolesta kaimalle, että k.o. haploryhmät näyttäisivät olevan N-CTS9976 ja N-Y143662.
Ainakin itselläni huomaan merkityn testiksi Y-111, vaikka on BigY tehty ja tulos sen mukainen.

:) Jaska

[Tiina Lietzén]

Kiitokset Jaskoille! Just ajattelin käydä lisäämässä nuo haploryhmät kokonaisuudessaan, mutta etäsukulais-Jaska ehti ensin.



Tiina

[Antti Järvenpää]

SNP tracker näkee asian näin.

CTS9976 on syntynyt noin 3600 vuotta sitten ja tämä toinen y143662 on syntynyt noin 400 vuotta ajanlaskun alun jälkeen ja se on samalla haplo polulla kuin tuo edellinen. Oletettavaa on, että jos on kyse saman suvun miespuolisista jälkeläisistä, niin heillä kaikilla on tuo Y143662 haplo, jos yhteinen esi-isä on historiallisella ajalla.

Ja tuo SNP cracker löytyy osoitteesta http://scaledinnovation.com/gg/snpTracker.html?fbclid=IwAR3V7q9BzoKK0PzQvsVOUuWFN FNbr3ed3NzuEagRIt-vWrkYU5FhxV4K7Mw

[Tiina Lietzén]

Kiitos Antti.
Pappani kanssa näillä miehillä on yhteinen esi-isä s. 1641 ja näiden kahden miehen yhteinen esi-isä syntyi 1812. Tämä Y143-tyyppi on tuon 1812 syntyneen pojanpojanpoika ja tämä toinen on yhden pojan kauempana 1812 syntyneestä.



Tiina

[Antti Järvenpää]

Y67 tai Y111 ovat aika karkeita analyyseja, joissa näiden testattujen STR:n perusteella päätellään haploryhmä, joka jää varsi kauas yleiselle tasolle ajallisesti. Sitten kun tehdään bigY tai yksittäisten SNP:n testaus, päästään hyvin lähelle nykyaikaa ja BigY:ssä tulee varmaan kaikille aivan omiakin SNP:tä.

Jos haplo Y143662 on syntynyt 400 vuotta ajanlaskun jälkeen, niin kaikilla tämän haplon jälkeläisillä on tämä haplo ja luultavasti tukku muitakin. Kaikilla on lisäksi se CTS9976 haplo, koska se on syntynyt jo n. 3600 vuotta sitten samalla haplopolulla.

Asian voi nähdä myös niin, että jos suvussa tiedetään vaikka y67 analyysin avulla, että kaikilla tutkituilla on sama yhteinen esi-isä, niin riittää, että vain yhdelle tehdään BigY analyysi, joka kertoo koko joukon päätehaplon ja mahdollisesti testatun yksityisiä haploja tai yhteisiä jonkun lähemmän sukulaisen kanssa.

Esimerkiksi itselläni on BigY:ssä henkilökohtaisia SNP:tä, sitten noin 350 vuotta sitten haarautunut haplo ja n. 500 vuotta sitten haarautunut haplo. Kun esimerkiksi oma sukuani on tutkittu lähinnä isonvihan jälkeen, niin kaikki mieslinjaiset yhteiseen isonvhan jälkeiseen esi-isään ovat tuota 350 vuotta vanhaa haploa. Periaatteessa siis riittää jos yksi tutkitaan, niin muutkin ovat sitä samaa haploa, jos vain muuten tiedämme heidän varmasti olevan kyseisen essi.isän jälkeläisiä.

Nuo henkilökohtaiset SNP:t tarkoittavat sitä, että niitä ei ole toistaiseksi tavattu kenellekään toisella samalla haplopolulla, mutta kun tutkitut lisääntyvät, voivat ne tarkentua päätehaploiksi kahdelle tai useammalle tutkitulle.

[Tiina Lietzén]

Kiitos Antti perusteellisesta selvityksestä. Itse olen näistä jutuista aivan pihalla.



Tiina

[Antti Järvenpää]

Kiitos Antti perusteellisesta selvityksestä. Itse olen näistä jutuista aivan pihalla.

Tiina

Tuo SNP Tracker eli jäljitin on hyvä ohjelmisto näiden haplojen jäljittämiseen. Siinä voi nuo aika arviot olla hieman toisia kuin yFull tai FTDNA vastaavissa palveluissa, mutta tämä on verrattomasti selkeämpi käyttää, jonkun tämän tapaisen pulman selvittämiseksi. Kukaanhan ei suoraan osaa sanoa mitään näistä kirjain ja numero yhdistelmistä, joskin yleisimmät voivat painua mieleen kovasti DNA:sta kiinnostuneille.

Jos haluaa lukea jotain yleistä DNA:sta niin ainakin kesän pehmeäkantisten kirjojen laareissa oli Adam Rutherford, Lyhyt historia meistä kaikista – Ihmiskunnan tarina geenien kertomana Bazar 2020, joka on ihan hyvä yleistajuinen kirja joka valaisee geeni tutkimusta hyvin laajasti ja antaa hyvää yleistietämystä aiheesta ja siitä kuinka vähän lopulta tiedämme ja ymmärrämme.

[Tiina Lietzén]

Kiitokset kirjavinkistä ja tuosta nettiosoitteesta. Laitoin sen suosikkeihini, jotta löydän sen toistekin.



Tiina

[Jaska]

Voinen paljastaa etäsukulaiseni puolesta kaimalle, että k.o. haploryhmät näyttäisivät olevan N-CTS9976 ja N-Y143662.
Ainakin itselläni huomaan merkityn testiksi Y-111, vaikka on BigY tehty ja tulos sen mukainen.

:) Jaska

Kiitoksia!
FTDNA:n Y-puussa noiden kahden tason välissä on 8 muuta mutaatioporrasta (ja ilmeisesti tuhatkunta vuotta). Ne eivät siis ole ihan peräkkäisiä, vaikka samaan linjaan osuvatkin.
https://www.familytreedna.com/public/y-dna-haplotree/N;name=N-Y143662

Siksi olisi tärkeää tietää, millä testillä tuo SNP-vahvistus on saatu: yksittäinen kohta testaamalla vai BigY:llä. Y111 näkyy kaiketi testinä myös BigY:n jälkeen (koska tietokannassa näkyy vain 111 markkeria, vaikka olisi tehty BigY), kun taas Y67 viitannee siihen, ettei BigY:tä ole tehty.

Jos kumpikin olisi tehnyt BigY-testin ja he olisivat oikeasti noin kaukana toisistaan, niin silloin he eivät olisi oikeasti sukulaisia, vaan jommankumman isälinjassa olisi väistämättä tapahtunut salasiitos. Jos taas tuo CTS9976 on vain yksittäisen SNP-kohdan testin tulos (mihin Y67 viittaa), niin silloin tällä miehellä hyvin luultavasti olisi myös kaikki tai suurin osa tuon toisen miehen mutaatioista.

Jos näiden kahden näytteen välinen geneettinen etäisyys 67:llä markkerilla olisi pieni, silloin uskaltaisi arvata, että oikeastikin ollaan sukua.

[Tiina Lietzén]

Kiitos selvityksestä, Jaska.



Tiina