PDA

Arkistonäkymässä ei tällä hetkellä lainaus erotu varsinaisesta viestistä. Suosittelemme että vilkaisette ns. täydellistä versiota: : Suomalaiset eivät ole geeniperimältään eurooppalaisia


Timo W
19.08.16, 10:59
http://www.tekniikkatalous.fi/tiede/suomalaiset-eivat-ole-geeniperimaltaan-eurooppalaisia-6574887


Taitaa olla mätäkuunjuttuja?


Omasta suvusta kyllä löytyy aika paljon eurooppalaisia.

Antti Järvenpää
19.08.16, 11:49
Laskeskelin, että 60.000 otos maailmanlaajuisesti tarkoittaisi, että suomalaisia olisi tutkittu noin 50-60, joka on tilastollisesti hyvin pieni otos.

No ehkäpä sieltä Naturen jutusta löytyy, mikä otos suomalaisia on oikeasti, mutta kun väitettä tukevaksi ainoaksi esimerkiksi otetaan yksi mutaatio (AKT2 mitä ei esiinny muualla), niin jutun kirjoittajalta on tainnut jäädä jotain ymmärtämättä.

Sitten kun katsoo, että jutussa viitataan METSIM- eli METabolic Syndrome In Men -tutkimukseen, jossa on tutkittu n. 10 000 Kuopiossa tai sen lähikunnissa asuvaa miestä ja toisaalta Fusion tutkimusta oli tehty 2007 mennessä 10 vuotta ja siihen on osallistunut noin 10 000 suomalaista koehenkilöä, mutta ei tarkempaa tietoa otoksen alueellisesta tai muusta jakaumasta, jää jopa miettimään sitä, miten tämä edustaisi tilastollisesti oikealla tavalla ylipäänsä suomalaisia.

No näin ajatellen tuosta 60.000 olisi noin 20.000 suomalaista, joten suomalainen otos määrältään olisi kyllä kunnossa, mutta kaikkea sitten lähes muuta 7 miljardia edustaisi 40.000 otos.

Jos kaikkea sitä DNA aineistoa, joka erottaa meidät vaikkapa banaanikärpäsestä, lähdetään analysoimaan, ei suomalaiset siitä mitenkään erityisesti erottaudu. Jos etsitään vain suomalaisissa esiintyviä mutaatiota niitä löytyy varmasti vaikka kuinka paljon, mutta niin niitä löytyy joka puolelta maailmaa ja niitä syntyy koko ajan lisää.

Kun esim. NewYorkin väestöstä iso osa ei ole koskaan käynyt kaupungin ulkopuolella, niin voitaisiin varmasti löytää myös NewYork spesifiä mutaatiota, aivan samoin kuin mistä hyvänsä muualta.

Jos ajan oman autosomaaliaieneiston ties minkä patteriston läpi, tulos on aina sama - kokolailla pohjois eurooppalainen perimä, joskin mukana on ripaus sieltä ja täältä eksoottisimmilta alueilta.

JHissa
19.08.16, 12:21
Laskeskelin, että 60.000 otos maailmanlaajuisesti tarkoittaisi, että suomalaisia olisi tutkittu noin 50-60, joka on tilastollisesti hyvin pieni otos.

No ehkäpä sieltä Naturen jutusta löytyy, mikä otos suomalaisia on oikeasti, mutta kun väitettä tukevaksi ainoaksi esimerkiksi otetaan yksi mutaatio (AKT2 mitä ei esiinny muualla), niin jutun kirjoittajalta on tainnut jäädä jotain ymmärtämättä.

Sitten kun katsoo, että jutussa viitataan METSIM- eli METabolic Syndrome In Men -tutkimukseen, jossa on tutkittu n. 10 000 Kuopiossa tai sen lähikunnissa asuvaa miestä ja toisaalta Fusion tutkimusta oli tehty 2007 mennessä 10 vuotta ja siihen on osallistunut noin 10 000 suomalaista koehenkilöä, mutta ei tarkempaa tietoa otoksen alueellisesta tai muusta jakaumasta, jää jopa miettimään sitä, miten tämä edustaisi tilastollisesti oikealla tavalla ylipäänsä suomalaisia.

No näin ajatellen tuosta 60.000 olisi noin 20.000 suomalaista, joten suomalainen otos määrältään olisi kyllä kunnossa, mutta kaikkea sitten lähes muuta 7 miljardia edustaisi 40.000 otos.

Jos kaikkea sitä DNA aineistoa, joka erottaa meidät vaikkapa banaanikärpäsestä, lähdetään analysoimaan, ei suomalaiset siitä mitenkään erityisesti erottaudu. Jos etsitään vain suomalaisissa esiintyviä mutaatiota niitä löytyy varmasti vaikka kuinka paljon, mutta niin niitä löytyy joka puolelta maailmaa ja niitä syntyy koko ajan lisää.

Kun esim. NewYorkin väestöstä iso osa ei ole koskaan käynyt kaupungin ulkopuolella, niin voitaisiin varmasti löytää myös NewYork spesifiä mutaatiota, aivan samoin kuin mistä hyvänsä muualta.

Jos ajan oman autosomaaliaieneiston ties minkä patteriston läpi, tulos on aina sama - kokolailla pohjois eurooppalainen perimä, joskin mukana on ripaus sieltä ja täältä eksoottisimmilta alueilta.
Lek M, ym. Analysis of protein-coding genetic variation in 60,706 humans. Nature. 2016 (doi:10.1038/nature19057)
http://www.nature.com/nature/journal/v536/n7616/full/nature19057.html
Kysymys on tunnetusta DNA-erosta Itä- ja Länsi-Suomen välillä
http://www.uusisuomi.fi/tiede-ja-ymparisto/201691-geenitutkijat-yllattyivat-eurooppa-nyt-jaettu-suomalaisiin-ja-ei
http://www.uef.fi/-/suomalaiset-eivat-ole-perimaltaan-eurooppalaisia
sillä tutkitusti länsisuomalaiset ovat lähempänä ruotsalaisia kuin itäsuomalaisia ja tämä johtuu pitkälti siitä, että Suomi on isolaatti Itä-Suomen kohdalta, johon on vaikuttanut etenkin nykyistä Suomea 1300-luvulla halkaissut Pähkinäsaaren rauhan raja. Länsi-Suomi on taas saanut uutta verta etenkin Ruotsista.

Miisamaija
19.08.16, 12:27
Pointti taitaa olla juuri pullonkaulaefektin eli isolaation vaikutuksen näkyminen aineistossa. Tulokset tuovat esiin Suomen maaperällä tapahtuneita muutoksia perimässä. Materiaalin edustavuuteen en ota kantaa.

Timo W
19.08.16, 16:17
Suomalaisten geenihistoria



http://www.elisanet.fi/alkupera/Suomalaisten_geenihistoria.pdf

Hannu Virttaalainen
19.08.16, 17:14
Lainaus "Hyvä esimerkki suomalaisesta geeniperinnöstä on tutkimuksessa löydetty AKT2-geenin geenimuutos, jota esiintyy yhdellä prosentilla suomalaista, mutta ei missään muualla maailmassa"

Siis mitä tämä 1%:lla esiintyvä muutos kertoo lopusta 99%:sta?
Tutkijan mukaan kaiken? Vai ymmärsinkö ihan väärin ...

Voiko siitä todeta jotain kaikista suomalaisista?

Sitten puhumista suomalaisista ja ruotsalaisista tässä kohtaa on vähän kuin puhuisi 1800-luvun alun maanviljelyksestä puhuen traktoreista ja leikkuupuimureista, Ei niitä tunnettu silloin.

Hannu Virttaalainen
19.08.16, 17:43
Alkuperäisen tutkimuksen nimi: "Analysis of protein-coding genetic variation in 60,706 humans"

Josta tehdään johtopäätös, että suomalaiset ihan erilaisia kuin eurooppalaiset. Siis koko perimän suhteen eikä vain "protein-coding" ominaisuuden osalta vai tutkittiinko koko perimää ja minä vaan olen yksinkertainen enkä ymmärrä?

Niin tämän suhteen siis 1% suomalaisista on erilaisia ja tutkittu Kuopion ympäristössä?

Miisamaija
19.08.16, 22:50
Missä kohtaa mainittu Suomalaisten geenihistoria selvitys
http://www.elisanet.fi/alkupera/Suomalaisten_geenihistoria.pdf

on mahdollisesti ristiriidassa alla selostettujen tutkimustulosten kanssa?
http://www.uusisuomi.fi/tiede-ja-ymparisto/201691-geenitutkijat-yllattyivat-eurooppa-nyt-jaettu-suomalaisiin-ja-ei
http://www.uef.fi/-/suomalaiset-eivat-ole-perimaltaan-eurooppalaisia

Miisamaija
19.08.16, 23:55
En kyllä havaitse mitään suurta ristiriitaa. Näkökulma vaan taitaa olla eri tutkimuksiin verrattuna.

Mikä tekee suomalaisten geeniperimästä erityisen?

”Finns” ja ”Europeans”; suomalaisten geeniperimän erilaisuudesta kertovat erityisesti kaksi seikkaa Naturessa ilmestyneessä tutkimuksessa
-Jo aiemmin on tiedetty, että suomalaisilla esiintyy tiettyjä taudinaiheuttaja-geenivirheitä, joita ei ole havaittu missään muussa maassa.
-Tuoreessa tutkimuksessa havaittiin lisäksi, että suomalaisilla esiintyy muihin eurooppalaisiin tai aasialaisiin väestöihin verrattuna runsaasti enemmän geenimuutoksia, joiden esiintyvyys väestössä on kohtalaisen yleinen, 1–5 prosenttia.
http://www.uusisuomi.fi/tiede-ja-ymparisto/201691-geenitutkijat-yllattyivat-eurooppa-nyt-jaettu-suomalaisiin-ja-ei

Uniikki kansa
https://www.youtube.com/watch?v=EVQLJasdD9I

Maailman tutkituimmat geenit
”Suomalaisten erikoislaatuinen geeniperimä sekä populaation pieni koko ovat tehneet Suomesta geneettisesti ehkä maailman tutkituimman kansan. Tällä hetkellä suomalainen geenitutkimus onkin maailman huippua, minkä lisäksi meidän geenimme kiinnostavat tutkijoita maailmanlaajuisesti.
"Suomalaisia tutkitaan geneettisesti enemmän kuin mitään muuta kansaa", Samuli Ripatti toteaakin. Suureksi osaksi tämä johtuu juuri suomalaisten erikoisesta geeniperimästä sekä populaation pienestä koosta. "Me kykenemme tunnistamaan harvinaiset muunnokset täällä helpommin, koska taustakohina on pienempi. Suomessa saatetaan 10 000 ihmisestä löytää esimerkiksi viisi sellaista, joilla on sekä äidiltä että isältä perittynä sammutettu geenimuutos ja he suojautuvat vaikkapa sydän- ja verisuonitaudeilta. Lontoossa saatettaisiin löytää ehkä miljoonasta ihmisestä yksi tällainen henkilö", Palotie toteaa. "Suomi on maailman suurin tällainen väestö, ja siksi geneettistä tutkimusta on erityisen lupaavaa tehdä Suomessa", Ripatti täydentää.
https://www.yhteishyva.fi/hyva-olo/suomalaiset-geenit-ovat-ainutlaatuisia/05562197
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0016747
http://www.nature.com/nature/journal/v536/n7616/full/nature19057.html

Timo W
20.08.16, 07:55
http://www.tekniikkatalous.fi/tiede/suomalaiset-eivat-ole-geeniperimaltaan-eurooppalaisia-6574887


Taitaa olla mätäkuunjuttuja?


Omasta suvusta kyllä löytyy aika paljon eurooppalaisia.



http://timo54.suntuubi.com/datafiles/userfiles/Image/Otto%20I%20of%20Saxony.jpg



http://genealogics.org/getperson.php?personID=I00020483&tree=LEO

http://genealogics.org/getperson.php?personID=I00020556&tree=LEO

http://genealogics.org/getperson.php?personID=I00020583&tree=LEO

http://genealogics.org/getperson.php?personID=I00298551&tree=LEO

http://genealogics.org/getperson.php?personID=I00489374&tree=LEO

https://www.adelsvapen.com/genealogi/Roos_af_Hjelms%C3%A4ter_nr_51

Timo W
20.08.16, 08:33
http://1.bp.blogspot.com/-sGzZXTxzxsI/VU0DaNj4mgI/AAAAAAAAErM/-zVM_TPlOoY/s1600/Berengar%2BII%2C%2Bking%2Bof%2BItaly%2B1.jpg



https://en.wikipedia.org/wiki/Otto-William,_Count_of_Burgundy


http://finnholbek.dk/getperson.php?personID=I9360&tree=2

Hannu Virttaalainen
20.08.16, 10:18
Tämä jo 2002 julkaistu juttu kannattaa lukea: http://www.tiede.fi/artikkeli/jutut/artikkelit/suomalaisten_alkupera_hahmottuu_pirullisen_hitaast

Kannattaa myös muistaa, että lähes jokaisella suomalaisella on amerikkalaisia (tarkemmin yhdysvaltalaisia) sukulaisia, mutta aika harvalla amerikkalaisella on suomalaisia sukulaisia. Kuitenkin paljon useammalla amerikkalaisella löytyy eurooppalaisia sukulaisia. Itsellä on amerkkalaisia pikkuserkkuja.

Minullakin on esipolvissa skotlantilaisia, ruotsalaisia, tanskalaisia (sekä nyky Tanskan että nyky Ruotsin puolelta), saksalaisia, liivinmaalainen ja yksi Isovihan aikainen todennäköisesti venäläinen sotilas. Isovihan aikainen venäläinen sotilas voi myös olla muutakin kuin 'aitovenäläinen'. Onkin joltain valloitetulta alueelta pakko-otettu.

Mutta edellä luetellut esimerkit eivät perimämielessä yleisesti kerro yhtään mitään (siis olenko eurooppalainen vai en). Perinnöllisten sairauksien suhteen ehkä voisivat kertoa jotain, jos oma dna:ini olisi testattu.

Vain säilynyt DNA näkyy testeissä, tehtiinpä ne elävillä, joita testattu vähän tai kuolleilla, joista näytteitä vain muutamia (siis verrattuna esim, viimeisen 2000 vuoden aikana eläneisiin ihmisiin)

DNA:n avulla voidaan selvittää jotain. Tiedän yhden aika selvän tapauksen sukututkimuksesta 1600-luvulta. Nykyaikana isyys varmistuu lähes 100%:sti, jos lapsi ja isä testataan.

Mutta kaikkeen DNA ei kykene antamaan vastausta, sekään ei ole innolla etsitty 'hopealuoti'.

Hannu Virttaalainen
20.08.16, 19:59
Laskeskelin, että 60.000 otos maailmanlaajuisesti tarkoittaisi, että suomalaisia olisi tutkittu noin 50-60, joka on tilastollisesti hyvin pieni otos.

No ehkäpä sieltä Naturen jutusta löytyy, mikä otos suomalaisia on oikeasti, mutta kun väitettä tukevaksi ainoaksi esimerkiksi otetaan yksi mutaatio (AKT2 mitä ei esiinny muualla), niin jutun kirjoittajalta on tainnut jäädä jotain ymmärtämättä.

Sitten kun katsoo, että jutussa viitataan METSIM- eli METabolic Syndrome In Men -tutkimukseen, jossa on tutkittu n. 10 000 Kuopiossa tai sen lähikunnissa asuvaa miestä ja toisaalta Fusion tutkimusta oli tehty 2007 mennessä 10 vuotta ja siihen on osallistunut noin 10 000 suomalaista koehenkilöä, mutta ei tarkempaa tietoa otoksen alueellisesta tai muusta jakaumasta, jää jopa miettimään sitä, miten tämä edustaisi tilastollisesti oikealla tavalla ylipäänsä suomalaisia.

No näin ajatellen tuosta 60.000 olisi noin 20.000 suomalaista, joten suomalainen otos määrältään olisi kyllä kunnossa, mutta kaikkea sitten lähes muuta 7 miljardia edustaisi 40.000 otos.

Jos kaikkea sitä DNA aineistoa, joka erottaa meidät vaikkapa banaanikärpäsestä, lähdetään analysoimaan, ei suomalaiset siitä mitenkään erityisesti erottaudu. Jos etsitään vain suomalaisissa esiintyviä mutaatiota niitä löytyy varmasti vaikka kuinka paljon, mutta niin niitä löytyy joka puolelta maailmaa ja niitä syntyy koko ajan lisää.

Kun esim. NewYorkin väestöstä iso osa ei ole koskaan käynyt kaupungin ulkopuolella, niin voitaisiin varmasti löytää myös NewYork spesifiä mutaatiota, aivan samoin kuin mistä hyvänsä muualta.

Jos ajan oman autosomaaliaieneiston ties minkä patteriston läpi, tulos on aina sama - kokolailla pohjois eurooppalainen perimä, joskin mukana on ripaus sieltä ja täältä eksoottisimmilta alueilta.

Sitten kaiken huippu on, että sisätautien lääketieteen tohtori ei ole ymmärtänyt jutun tärkeintä pointtia oman ja muunkin genetiikkaa, joka on perustutkimusta, soveltavan tutkimuksen kannalta. Pointti ei ole ovatko suomalaiset eurooppalaisia vai ei. Pihvi on, että maapallon yli 7 miljardin (7000000000) väestöstä on siis 60000 näytettä ja Suomen 5 miljoonasta (5000000) 20 000 näytettä.

Jos hän keskittyisi miettimään ja käyttämään sen tarjoamia mahdollisuuksia, jota hän kyllä tekeekin kuitenkaan ymmärtämättä sen koko merkitystä. Tämä kissanhännän nosto menee siis ihan metsään.

Tällaisia esimerkkejä 1% prosentin tauteihin vaikuttavia DNA mutaatioita populaatioissa löytyy kuten Antti sanoo muualtakin. Joten siellähän nämä mahdollisuudet ovat tämän Suomen laajan DNA materiaalin käyttöön lääketieteellisiin ja ehkä muihinkin startuppeihin. Ehkä startup ei kuitenkaan ole aivan oikea sana, kun puhutaan tieteestä.

Mutta uutisointi on jotain niin tämän foorumin alaosaston nimen mukaista ...

Asian vierestä!

Kuten omatkin hölinät useimmiten.

Antti Järvenpää
24.08.16, 13:54
Nyt näyttävät lehdet oikovan tämän aloituksen artikkeleita.

http://www.uusisuomi.fi/tiede-ja-ymparisto/202085-kommentti-uutiseen-suomalaisten-geeniperimasta

Fishersson
24.08.16, 19:52
Hyvä, että oikaistiin, koska uutinen oli ankka. Tutkimus ei tue väitettä, että suomalaiset eivät olisi eurooppalaisia. Tämän on todennut Twitterissä mm. tutkimushankkeen tiedottamisesta vastaava amerikkalainen professori MacArthur.

Timo W
25.08.16, 07:21
Länttä ja Itää.

Ivan Vladislav of Bulgaria (https://en.wikipedia.org/wiki/Ivan_Vladislav_of_Bulgaria)

http://timo54.suntuubi.com/datafiles/userfiles/Image/Ivan%20Vladislav%20of%20Bulgaria%201.jpg




Harold Godwinson (https://en.wikipedia.org/wiki/Harold_Godwinson)

http://timo54.suntuubi.com/datafiles/userfiles/Image/Harold%20Godwinson%201.jpg

Matti Lund
25.08.16, 10:02
Laskeskelin, että 60.000 otos maailmanlaajuisesti tarkoittaisi, että suomalaisia olisi tutkittu noin 50-60, joka on tilastollisesti hyvin pieni otos.


M Lu:
Tuo 50-60 on ollut Suomessa monesti se näytemäärä, johon kaikkialle syleilevät, mutta maan rajoissa pysyvät projektit ovat perustaneet omat tuloksensa kansakunnan perimästä.



No ehkäpä sieltä Naturen jutusta löytyy, mikä otos suomalaisia on oikeasti, mutta kun väitettä tukevaksi ainoaksi esimerkiksi otetaan yksi mutaatio (AKT2 mitä ei esiinny muualla), niin jutun kirjoittajalta on tainnut jäädä jotain ymmärtämättä.


M Lu:
Julkistuksen viittaamasta kahdesta alaprojektista selviää tämä tarkemmin.


Sitten kun katsoo, että jutussa viitataan METSIM- eli METabolic Syndrome In Men -tutkimukseen, jossa on tutkittu n. 10 000 Kuopiossa tai sen lähikunnissa asuvaa miestä ja toisaalta Fusion tutkimusta oli tehty 2007 mennessä 10 vuotta ja siihen on osallistunut noin 10 000 suomalaista koehenkilöä, mutta ei tarkempaa tietoa otoksen alueellisesta tai muusta jakaumasta, jää jopa miettimään sitä, miten tämä edustaisi tilastollisesti oikealla tavalla ylipäänsä suomalaisia.

No näin ajatellen tuosta 60.000 olisi noin 20.000 suomalaista, joten suomalainen otos määrältään olisi kyllä kunnossa, mutta kaikkea sitten lähes muuta 7 miljardia edustaisi 40.000 otos.

M Lu:
Tässä METSIMissä, joka oli toinen projekteista, josta tässä otantoja on, 10000 oli niiden määrä, joilta otettiin niitä testejä, mitä yleislääkärikin labraltaan otattaa, jos epäilee potilaalla orastavan sokeritaudin oireita ja potilas on ylipainoinen.

Sen lisäksi lähetettiin 1040 kuopiolaisen miehen sylkinäyte geenilaboratorioon USA:han genomin kartoitusta varten.

Siis tässä ryhmänä ainoastaan kuopiolaisia miehiä!

Toisaalta on 1040 genominotosta, mikä saattaa olla suurin määrä näissä yhteyksissä Suomessa, kun yleensä kohteena on ollut muutamia kymmeniä näytteitä.

Toinen juttu on sitten se, että verrokkina voi olla käytettävissä huomattavasti suurempi geenitestien tulosten tietokanta.

Tässä oli vähän yli 60000 ulkomaista verokkia.

Luulen että jotkin käsittivät väärin niin, että Suomessa oli tehty 60000 geenitestiä, joiden tuloksia esiteltiin!


Kun esim. NewYorkin väestöstä iso osa ei ole koskaan käynyt kaupungin ulkopuolella, niin voitaisiin varmasti löytää myös NewYork spesifiä mutaatiota, aivan samoin kuin mistä hyvänsä muualta.


M Lu:

Joo, tässä voidaan rinnastaa Kuopio ja New York ja luulen, että kertyy suuri määrä vissejä eroja, muitakin kuin se, että Nykki on himpun verran suurempi kuin Kuopio.


Jos ajan oman autosomaaliaieneiston ties minkä patteriston läpi, tulos on aina sama - kokolailla pohjois eurooppalainen perimä, joskin mukana on ripaus sieltä ja täältä eksoottisimmilta alueilta.

M Lu:

Uutisoinnissa oli tietysti käytetty useassa kohtaa aivan vääriä sanoja kuten nykyään yhden ja toisen asian uutisoinnissa on tapana. Uutisointien sekavuus, ellei suorastaan höperyys, on nykyään pikemminkin sääntö, kun yritetään kiinnittää kovasti yleisön huomiota. Uutinen kuin uutinen tahtoo nykyään olla tavallaan aina oma ankkansa.

Meidän olisi kriittisinä tutkijoina hyvä tämä aina muistaa.

terv Matti