PDA

Arkistonäkymässä ei tällä hetkellä lainaus erotu varsinaisesta viestistä. Suosittelemme että vilkaisette ns. täydellistä versiota: : DNA tulosten vertailu


TimoT
13.02.14, 12:27
DNA-taulukosta löytyy Matti Meikäläisen, s. 1550 ja Heikki Heikäläisen, s. 1650 tulokset. Miten maallikko voi lukea niistä Matin ja Heikin sukulaisuussuhteen?
Toivoisin vastausta sellaisilla sanavalinnoilla, että umpisavolainenkin ymmärtää tai sitten linkkiä selväkieliselle sivustolle.

Fishersson
13.02.14, 18:49
Riippuu Heikäläisen ja Meikäläisen geneettisestä etäisyydestä. Jos se on 67 markkerin tuloksissa 1-2, on todennäköistä, että 1550 syntynyt Matti Meikäläinen tai on Meikäläisten ja Heikäläisten sukujen yhteinen esi-isä. Tarkka sukuyhteys pitää kaivaa esille tuon ajan henki- ja maakirjoista.

TimoT
13.02.14, 19:30
Riippuu Heikäläisen ja Meikäläisen geneettisestä etäisyydestä. Jos se on 67 markkerin tuloksissa 1-2, on todennäköistä, että 1550 syntynyt Matti Meikäläinen tai on Meikäläisten ja Heikäläisten sukujen yhteinen esi-isä. Tarkka sukuyhteys pitää kaivaa esille tuon ajan henki- ja maakirjoista.
Miten se geneettinen etäisyys lasketaan noista pitkistä numerosarjoista?

Fishersson
13.02.14, 21:57
Niin, sehän lasketaan niiden lukujen eroista henkilöiden välillä eli mutaatioiden määrästä niissä DYS:ien arvoissa, mutta ainakin FTDNA:n tulossivuilla se näkyy valmiina Osumat-kohdassa (Matches) ensimmäisenä sarakkeena (Genetic Distance= geneettinen etäisyys) eli sitä ei tarvitse erikseen laskea. Se etäisyys ilmoitetaan kunkin osuman osalta suhteessa siihen testattuun henkilöön, jonka tuloksista taulukossa on kyse.

TimoT
13.02.14, 22:16
Me ei taideta olla oikein samalla aaltopituudella. Tuolla tulossivuilla on pitkä listaus henkilöistä, jotka on testattu. Eli siinä on vasemmalla puolella taulukkoa nimi ja sitten sarakkeissa numeroita, jotka eivät kerro maallikolle mitään. Voinko verrata sieltä vaikka kahta satunnaisesti valittua henkilöä keskenään? Vain onko vertailumahdollisuus vasta jossakin jäsensivuilla?

Fishersson
13.02.14, 22:45
Minä puhuin jokaisen testatun omasta henkilökohtaisesta tulossivusta.

Voi niitä eroja laskea niistä yleisistäkin taulukoista esim. Sukujuttujen taulukosta ja Family Tree DNA - Finland DNA Projectin taulukosta, mutta ei kannata kyllä aivan summassa vertailtavia valita. Pitää jo olla ennakkotieto mahdollisesta sukulaisuudesta. Niissähän on se huono puoli, ettei niissä kerrota testattujen nimiä.

TimoT
13.02.14, 22:49
Tuota Suomiprojektin taulukkoa katselin. Miten se ero lasketaan niistä luvuista?

Fishersson
14.02.14, 11:11
Kukin markkeri verrataan henkilöiden kohdalta erikseen. Jos esim. toisella on DYS393 14 ja toisella 13. Ero eli GD on 1. Näin käydään läpi kaikki markkerit ja saadut erot lasketaan yhteen.

Jos arvot ovat jossakin markkerissa esim. toisella 8 ja toisella 10, on ero silloin luonnollisesti 2 (ns. kahden askeleen hyppäys). Tämän voisi joku suurempi asiantuntija vielä vahvistaa, koska näissä useamman askeleen hyppäysten laskemisessa on muistaakseni eri laskentatapoja?

TimoT
14.02.14, 15:07
Kiitos, nyt alan käsittämään.
Entäs sitten nämä markkerit, joissa on useampia lukuja (esim. 11-12)? Verrataanko niissäkin jokaista erikseen?
Sitten siellä on vielä yksi tuttu, jolla on samalla nimellä kaksi tulosta, kaikki markkerit ovat samoja, mutta haplotyyppi eri (N ja N1c1)?

Fishersson
14.02.14, 16:35
Päteviä vastauksia kysymyksiisi löytyy Jaakko Häkkisen tästä jutusta:
http://www.elisanet.fi/alkupera/Geenisukututkimus.pdf

Kuten esim. nämä:

Kaksosmutaatio (twin mutation) = mutaatio, jossa kaksi vierekkäistä locusta muuttuu yhdessä: esimerkiksi DYS464a,b = 14 14 > 15 15. Käsitellään yhtenä mutaationa silloin kun sukulinjassa ei esiinny sellaisia välimuotoja, joissa vain toinen olisi muuttunut.

Tuplamutaatio (double mutation) = mutaatio, jossa yhden locuksen arvo muuttuu kerralla kaksi askelta: esimerkiksi DYS449 = 27 > 29. Käsitellään yhtenä mutaationa silloin kun sukulinjassa ei esiinny välimuotoja (eli arvoa 28).

Ero N- ja N1c1-haploryhmän välillä johtuu siitä, että jälkimmäinen on tehnyt STR-mutaatio-testin lisäksi ns. Deep Clade-testin, jossa on testattu muutama SNP-mutaatio. N1c1 haploryhmä merkitsee, että ainakin SNP M178 on positiivinen. Edellinenkin todennäköisesti kuuluisi samaan ryhmään N1c1, jos tekisi ko. testin.

blue-eyed
14.02.14, 17:26
TimoT

tässä on kaksi hyvää ryhmää Facebookin puolella, joissa on paljon asiantuntijoita, jotka mielellään opastavat Sinua näihin DNA:n saloihin :)


https://www.facebook.com/groups/FinlandDNA/

https://www.facebook.com/groups/556434877778795/

TimoT
14.02.14, 20:41
Kiitos Arlalle ja terveisiä!
Minä en ole vielä tuonne facebookiin sotkeentunut, ehkä joskus.

blue-eyed
15.02.14, 09:21
Ai, sinä oletkin SE TimoT, siis mieheni sukuun kuuluva :) Olet otattanut itsestäsi DNA:n, oletko myös vaimostasi? Kannattaisi otattaa vaimostasi se serkkutesti eli Family Finder DNA, niin me voisimme vertailla Pajusen sukua.

P.S. Kyllä kannattaisi liittyä Facebookiin, vaikka ei muuten, niin juuri näiden DNA-ryhmien vuoksi. Kummassakin ryhmässä on Suomen DNA-sukututkimuksen uranuurtajia ja guruja kuten Marja Pirttivaara, Jaakko Häkkinen, Sari Heimonen ja monia muita.


Myöhästyneet ystävänpäivähalaukset, Timo :)

Fishersson
15.02.14, 11:09
Ihmettelen vain onko tarpeen sotkea DNA-sukututkimusta Naamakirjaakin ja ties vaikka mihin (ja vain siksi kun se on mahdollista ja muka muodikasta), kun meillä on näitä hyviä foorumeitakin. En aio liittyä.

Juha
15.02.14, 13:09
Facebookissa tavoittaa suuremman yleisön - ehkä siksi :)

Juha

blue-eyed
15.02.14, 13:43
Facebookissa tavoittaa suuremman yleisön - ehkä siksi :)

Juha

ja siksi, että siellä saa vastauksen ongelmiinsa melkein välittömästi. Facebook on niin nopea, että kun olet saanut viestisi loppuun ja lähettänyt sen maailmalle ja samassa silmänräpäyksessä huomaatkin, että voi äite, nyt tuli virhe, poistan viestini ja kirjoitan uuden. Vaikka tähän toimintaan ei menisi kuin muutama sekunti, niin aina joku on ennättänyt lukea ja nähdä tuon aikaisemman viestin. Joten vastauskin voi tulla yhtä nopeasti. Facebookin sukututkimusryhmät sopivat nykyaikaisille malttamattomille ihmiselle sekä kokemattomille, jotka arkailevat tuoda itseään julki täällä ns. arvokkaiden ihmisten joukossa.

Nykään noiden ryhmien adminit ovat harjaantuneet portinvartijoina niin paljon, että häiriköitä ja turhan vouhottajia ei ryhmissä enää esiinny. Eli ryhmät ovat kohottaneet huomattavasti profiiliaan.

Korhoant
15.02.14, 15:07
ja siksi, että siellä saa vastauksen ongelmiinsa melkein välittömästi. Facebook on niin nopea, että kun olet saanut viestisi loppuun ja lähettänyt sen maailmalle ja samassa silmänräpäyksessä huomaatkin, että voi äite, nyt tuli virhe, poistan viestini ja kirjoitan uuden. Vaikka tähän toimintaan ei menisi kuin muutama sekunti, niin aina joku on ennättänyt lukea ja nähdä tuon aikaisemman viestin. Joten vastauskin voi tulla yhtä nopeasti. Facebookin sukututkimusryhmät sopivat nykyaikaisille malttamattomille ihmiselle sekä kokemattomille, jotka arkailevat tuoda itseään julki täällä ns. arvokkaiden ihmisten joukossa.

Nykään noiden ryhmien adminit ovat harjaantuneet portinvartijoina niin paljon, että häiriköitä ja turhan vouhottajia ei ryhmissä enää esiinny. Eli ryhmät ovat kohottaneet huomattavasti profiiliaan.
Ei tunnu olevan nopea. Kaksi kysymystä olen lähettänyt mainitsemillesi henkilöille jo viikkoja sitten, eikä vastausta ole tullut kummaltakaan?
Parhaiten löytää tietoa, kun etsii netistä itse, mutta aikaa se näyttää vaativan.
Ystävällisin terveisin Martti K :)

Jaska
15.02.14, 23:47
P.S. Kyllä kannattaisi liittyä Facebookiin, vaikka ei muuten, niin juuri näiden DNA-ryhmien vuoksi. Kummassakin ryhmässä on Suomen DNA-sukututkimuksen uranuurtajia ja guruja kuten Marja Pirttivaara, Jaakko Häkkinen, Sari Heimonen ja monia muita.
Korjaan sen verran, että minä (Jaakko Häkkinen) en ole Facebookissa. Tavoittavuus sillä toki varmaan olisi laaja, kun suositellut ryhmät leviävät "kavereiden" tietoisuuteen. Vastauskin saattaa tulla nopeasti, jos joku sattuu päivystämään, mutta itse saisin mieluummin perusteellisemman vastauksen seuraavana päivänä kuin lisäkysymyksiä herättävän pikavastauksen heti.

Jaska
16.02.14, 00:32
DNA-taulukosta löytyy Matti Meikäläisen, s. 1550 ja Heikki Heikäläisen, s. 1650 tulokset. Miten maallikko voi lukea niistä Matin ja Heikin sukulaisuussuhteen?
Toivoisin vastausta sellaisilla sanavalinnoilla, että umpisavolainenkin ymmärtää tai sitten linkkiä selväkieliselle sivustolle.
Suattoohassenniinniikkoettoossannoo...

Geenitutkimuksen (tässä esimerkiksi isälinjan eli Y-kromosomin DNA:n) tarkkuus ei aivan tavoita kaikkia todellisia esi-isiä: 67:llä markkerilla (tällä hetkellä yleisimmin testattu) tapahtuu yksi mutaatio keskimäärin kahdeksassa sukupolvessa, ja 111:llä markkerilla yksi mutaatio keskimäärin viidessä sukupolvessa. Tämä merkitsee, että sinun haplotyyppisi (se pitkä lukusarja, joka alkaa esim. 14 24 14 11 11 13...) on luultavasti sama kuin ainakin muutamilla esi-isilläsikin.

Nykyistä mutaatiosukupolvea siis edustatte sinä ja kaikki ne esi-isäsi, joilla oli täsmälleen sama haplotyyppi. Kun mennään taaksepäin tarpeeksi monia sukupolvia, saavutetaan yhtä mutaatioaskelta aikaisempi haplotyyppi: se on muuten samanlainen kuin sinun, mutta jossakin kohdassa on eri lukuarvo, esim. 14:n tilalla on 13. Tällöin GD eli geneettinen etäisyys on 1/67 tai 1/111.

[Family Tree DNA:n tietokannoissa jokainen muuttunut kohta ja lukuarvon muutos yhdellä lasketaan yhdeksi mutaatioksi, mutta tämä ei aina vastaa todellisuutta. Tuossa ketjun ensimmäisellä sivulla olikin esimerkkejä kaksosmutaatiosta, jolloin kaksi markkeria eli kohtaa muuttuu yleensä tai aina samanaikaisesti, ja tuplamutaatiosta, jolloin yhdessä markkerissa tapahtuu kerralla kahden askeleen mutaatio (esim. 13 > 15). Tällaiset tilanteet ovat vain näennäisesti kaksi mutaatioaskelta mutta todellisuudessa vain yhden, eli ne pitäisi laskea vain yhdeksi mutaatioksi.]

Myös tuo toinen, yhtä mutaatioaskelta aikaisempi haplotyyppi ilmeni samanlaisena useilla todellisilla esi-isillä monien sukupolvien ajan. Jos tarpeeksi monta sukuhaaraa testattaisiin, saataisiin varmuudella selville, kenessä todellisessa esi-isässä mikäkin mutaatio on tapahtunut, eli sukupuuhun voitaisiin lisätä sellaisia mielenkiintoisia kohtia kuin:
Mikko Heikinpoika Tuppurainen, s. 1745, DYS388 = 12 > 11.

DYS388 on erään markkerin tunnuskoodi, ja siinä kohdassa on siis lukuarvo 12 muuttunut lukuarvoksi 11, koska arvo 11 esiintyy kaikilla Mikko Heikinpojan jälkeläisillä muttei missään hänen veljistään alkavissa sukuhaaroissa.

Monesti tietokannoissa on lähisukuisia näytteitä, joiden varhaisin tunnettu esi-isä edustaa samaa todellista isälinjaa, eli on joko yksi ja sama esi-isä tai tämän isä tai poika. Tämä johtuu siitä, että eri testihenkilöt ovat selvittäneet sukuaan eri aikasyvyyteen - sitä ei siis pidä tulkita niin, että jokin näytteistä edustaisi juuri tiettyä esi-isää ja jokin toinen varhaisempaa tai myöhäisempää esi-isää.

Olisi suotavaa, että geenitestaajat liittäisivät omalle sivulleen (jonka saa kun tilaa testipaketin Family Tree DNA:lta) sukupuun, josta voisi katsoa koko todellisen sukulinjan (isälinjan). Voi nimittäin olla, että pelkän geenitestin perusteella sukulinjojen välinen suhde näyttää väärältä. Tämä johtuu siitä, että mutaatiot eivät tapahdu vakionopeudella, vaikka isoista otoksista keskimääräinen sukupolvimäärä per mutaatio voidaankin laskea. Jossain linjassa voi tapahtua mutaatioita sattumalta parin todellisen sukupolven välein, kun taas jossain toisessa linjassa voi kulua yli 10 todellista sukupolvea ilman yhtäkään mutaatiota. Isäksi tuleminen vanhemmalla iällä voi vaikuttaa tähän: 40-vuotiaan Y-kromosomissa on ollut kaksi kertaa pidempi aika mutaatioiden tapahtua kuin 20-vuotiaan Y-kromosomissa.

Tiedetään tapauksia, joissa A ja B ovat sukututkimuksen mukaan läheisempää sukua keskenään kuin C:n kanssa, mutta DNA:n osalta B saattaakin olla lähempänä C:tä (esim. GD 1/67) kuin A:ta (esim. GD 2/67). Ilman sukututkimustietoa tulisi siis piirrettyä virheellinen sukupuu. Tämä eri linjojen erilaisista mutaatiotiheyksistä johtuva virhemahdollisuus on pidettävä mielessä myös esihistorialliseen aikaan edettäessä.

Nyt sitten varsinaiseen kysymykseesi:
Meikäläisen ja Heikäläisen todellista sukulaisuussuhdetta ei valitettavasti näe geenilinjoista, ainakaan vielä nykyisellä tarkkuudella. Voidaan vain sanoa, että nämä kaksi isälinjaa ovat lähisukuisia, ja GD:n perusteella voidaan laskea todennäköinen aikasyvyys yhteiseen esi-isään: jos GD on 2/67, suurimmalla todennäköisyydellä kummankin testihenkilön isälinjassa on tapahtunut yksi mutaatio yhteisen esi-isän jälkeen, eli aikasyvyys olisi keskimäärin 8 todellista sukupolvea (67:llä markkerilla keskimäärin sen verran siis vie aikaa yhden mutaation ilmaantuminen).

Geenisukututkimus on perinteisen sukututkimuksen ja geenitutkimuksen yhdistämistä; geenitutkimus yksin ei tuota riittävän tarkkaa tietoa historiallisesti todennetuista esivanhemmista. Mutta siinä vaiheessa kun halutaan sukulinjan historiallisia lähteitä kaukaisempaan menneisyyteen, on geenitutkimus ainoa keino. Uskottavien tulosten saamiseksi silloinkin on tärkeää pohjustaa lähtökohta mahdollisimman vankan sukututkimustiedon varaan, jotta sukulinjan varhaisimman tunnetun esi-isän haplotyyppi voidaan rekonstruoida jälkeläislinjojen perusteella.


P.S. Korhoant, mikä on se sinua askarruttanut kysymys, johon et ole saanut vastausta?

Korhoant
16.02.14, 09:16
Terve.
Kysymykseni oli yksi tyypillinen minun "tyhmä" kysymykseni, jota kadun heti kysymyksen lähetettyäni. Ei enää minulle niin tärkeä.
Ystävällisin terveisin Martti K :)

Karoliini
16.02.14, 10:55
Korjaan sen verran, että minä (Jaakko Häkkinen) en ole Facebookissa. Tavoittavuus sillä toki varmaan olisi laaja, kun suositellut ryhmät leviävät "kavereiden" tietoisuuteen. Vastauskin saattaa tulla nopeasti, jos joku sattuu päivystämään, mutta itse saisin mieluummin perusteellisemman vastauksen seuraavana päivänä kuin lisäkysymyksiä herättävän pikavastauksen heti.

Jaska ei vaatimattomana miehenä mainostanut omaa forumiaan,joka lienee Suomen paras.Muinainen Suomi-forumia voi lukea kuka tahansa ja ainoastaan kirjoittaminen vaatii muodollisen kirjautumisen.
Jaskan forumilla aiheittain järjestetyt ketjut myös helpottavat tiedon löytämisen pitkienkin aikojen kuluttua.
http://muinainensuomi.foorumimme.com/viewforum.php?f=10&sid=58ddf7f79851e0da941513b21cca6dba

TimoT
16.02.14, 11:04
Kiitosta, nyt alkaa selvetä. Olen kyllä lukenut aikaisemminkin tuon Jaskan artikkelin, mutta se ei ole oikein auennut.
En ole itse ostanut vielä DNA-testiä, harkinnassa on. Mutta ennen päätöstä pitää tietysti tietää, mitä on ostamassa, dollareistahan kuitenkin on kyse.
Tuolta DNA tietokannasta huomasin kaksi tulosta omalla sukunimelläni, ruotsalaisserkkuja tosin, niissä on äkkiä katsottuna eroa vain yhdessä markkerissa, joten lienevät keskenään sukua. Sitten siellä oli kaksi naapurini ruotsalaiserkkua, joilla oli täysin erilaisia lukemia keskenään. Eli eivät siis liene mitään sukua keskenään. Kaskisuomalaiset tietokanta sitten näyttää, että toinen noista naapureista lähtikin Suomesta täysin eri sukunimellä kuin tuohon on merkitty. Tässä tapauksessa ehkä olisi syytä merkitä tuolle henkilölle tulosteisiin myös tämä alkuperäinen nimi.

PS. Tuo Karoliinin linkki on uutta minulle. Vaikuttaa mielenkiintoiselta.

Erkki
17.02.14, 14:33
Suattoohassenniinniikkoettoossannoo...

Jossain linjassa voi tapahtua mutaatioita sattumalta parin todellisen sukupolven välein, kun taas jossain toisessa linjassa voi kulua yli 10 todellista sukupolvea ilman yhtäkään mutaatiota. Isäksi tuleminen vanhemmalla iällä voi vaikuttaa tähän: 40-vuotiaan Y-kromosomissa on ollut kaksi kertaa pidempi aika mutaatioiden tapahtua kuin 20-vuotiaan Y-kromosomissa.



Tämä mutaation tapahtumahetki, milloin se täsmällisesti ottaen tapahtuu?
Onko hetki myös autosomalien kromosomien kohdalla sama ja onko myös mtDNA:lla sama hetki? Edelleen onko sama hetki sekä STR- että SNP-mutaatioilla?

Jaska
17.02.14, 16:16
Tämä mutaation tapahtumahetki, milloin se täsmällisesti ottaen tapahtuu?
Onko hetki myös autosomalien kromosomien kohdalla sama ja onko myös mtDNA:lla sama hetki? Edelleen onko sama hetki sekä STR- että SNP-mutaatioilla?
En ole varma, ymmärsinkö mitä kysymyksellä haet...
Mutaatio voi tapahtua millä hetkellä tahansa, eikä sitä voi ennustaa. Y-kromosomia (isälinja) tai mitkondriaalista DNA:ta (äitilinja) ajatellen tuskin milloinkaan tapahtuu kahta mutaatiota samanaikaisesti. Ja vaikka yksilön koko DNA:n laajuudelta tarkasteltaisiin, niin tuskinpa kahdessa eri kohdassa tapahtuu mutaatioita samalla minuutilla.

Tuolta DNA tietokannasta huomasin kaksi tulosta omalla sukunimelläni, ruotsalaisserkkuja tosin, niissä on äkkiä katsottuna eroa vain yhdessä markkerissa, joten lienevät keskenään sukua. Sitten siellä oli kaksi naapurini ruotsalaiserkkua, joilla oli täysin erilaisia lukemia keskenään. Eli eivät siis liene mitään sukua keskenään. Kaskisuomalaiset tietokanta sitten näyttää, että toinen noista naapureista lähtikin Suomesta täysin eri sukunimellä kuin tuohon on merkitty. Tässä tapauksessa ehkä olisi syytä merkitä tuolle henkilölle tulosteisiin myös tämä alkuperäinen nimi.
Se tässä on harmillista, että esivanhempaistiedot ovat jokaisen testaajan omalla vastuulla. Jotkut ovat selvittäneet sukulinjaansa pidemmälle kuin toiset, ja siksi ei listoissa näy sama esi-isä, vaikka molemmat polveutuisivat siitä. Toivoisi, että lähiosuma eri sukunimellä innostaisi penkomaan omiakin juuria pidemmälle. Kuulemma monet osumat eivät vastaa, vaikka heidän sähköpostiosoitteensa saakin tietoon.

Erkki
18.02.14, 18:40
En ole varma, ymmärsinkö mitä kysymyksellä haet...
Mutaatio voi tapahtua millä hetkellä tahansa, eikä sitä voi ennustaa. Y-kromosomia (isälinja) tai mitkondriaalista DNA:ta (äitilinja) ajatellen tuskin milloinkaan tapahtuu kahta mutaatiota samanaikaisesti. Ja vaikka yksilön koko DNA:n laajuudelta tarkasteltaisiin, niin tuskinpa kahdessa eri kohdassa tapahtuu mutaatioita samalla minuutilla.


Se tässä on harmillista, että esivanhempaistiedot ovat jokaisen testaajan omalla vastuulla. Jotkut ovat selvittäneet sukulinjaansa pidemmälle kuin toiset, ja siksi ei listoissa näy sama esi-isä, vaikka molemmat polveutuisivat siitä. Toivoisi, että lähiosuma eri sukunimellä innostaisi penkomaan omiakin juuria pidemmälle. Kuulemma monet osumat eivät vastaa, vaikka heidän sähköpostiosoitteensa saakin tietoon.

Jos et ymmärtänyt kysymystäni, niin luulen - arvaan - veikkaan mitä vastaukseesi sisältyi.
Kysyin, koska tämä asia ei ole tullut (etsinnöistäni huolimatta) koskaan okulaariini. Mutaatioista puhutaan, mutta mutaatioiden syntyä tai syntyhetkeä ei missään selitetä kansantajuisesti. Jos teet artikkelin, niin kiitos etukäteen.

Mutta kaipaisin vielä selitystä autosomalien kromosomien (niiden 22 muun) mutatoitumisista. Eihän meidän elämäämme säätele pelkkä Y-kromosomi tai mitokondriot?

Vastaukseni viipyi, koska SukuForumille kirjautuminen on todennäköisyyksissä mainiten minulle Lotto-luokkaa kaksi ja varanumero (parhaimmillaan).

Sari H
18.02.14, 20:33
Ei tunnu olevan nopea. Kaksi kysymystä olen lähettänyt mainitsemillesi henkilöille jo viikkoja sitten, eikä vastausta ole tullut kummaltakaan?
Parhaiten löytää tietoa, kun etsii netistä itse, mutta aikaa se näyttää vaativan.
Ystävällisin terveisin Martti K :)

Tervehdys Martti - jos olet minulta kysynyt - on kysymyksesi kyllä mennyt ohi silmieni..eli minullehan voi pistää vaikka säpoa etunimi.sukunimi*gmail.com tai sitten tuolla GS ryhmässä. :)

Sari H
18.02.14, 20:35
Jaska ei vaatimattomana miehenä mainostanut omaa forumiaan,joka lienee Suomen paras.Muinainen Suomi-forumia voi lukea kuka tahansa ja ainoastaan kirjoittaminen vaatii muodollisen kirjautumisen.
Jaskan forumilla aiheittain järjestetyt ketjut myös helpottavat tiedon löytämisen pitkienkin aikojen kuluttua.
http://muinainensuomi.foorumimme.com/viewforum.php?f=10&sid=58ddf7f79851e0da941513b21cca6dba

Suosittelen tätä myöskin, sieltä löytyy laidasta laitaan tietoa - varaa aikaa lukemiseen :)

Sari H
18.02.14, 20:37
Tämä mutaation tapahtumahetki, milloin se täsmällisesti ottaen tapahtuu?
Onko hetki myös autosomalien kromosomien kohdalla sama ja onko myös mtDNA:lla sama hetki? Edelleen onko sama hetki sekä STR- että SNP-mutaatioilla?

Mutaatiot tapahtuvat aina esim YDNA:ssa isän ja pojan välissä- saattaa olla myös useita mutaatioita, ne eivät ole säännöllisiä eikä niistä voida sanoa koska ja milloin, ne vaan tapahtuvat. Ovat tavallaan pieniä kirjoitusvirheitä :) DNA testauksella saa todennäköisyyksiä ei eksaktia aikaa... :)

- Lisäys ai Jaska olikin vastannut tähän :)

TimoT
24.05.14, 06:41
Millä perusteella henkilöt on järjestetty Suomi DNA tulossivulla saman haploryhmän sisällä?

Jaska
24.05.14, 14:27
Millä perusteella henkilöt on järjestetty Suomi DNA tulossivulla saman haploryhmän sisällä?
Aina Vasemmanpuoleisimman markkerin arvojen perusteella pienimmästä alkaen. Tähän tapaan:
13 23 14 11 11 13
13 24 14 11 11 13
14 23 14 11 11 13
14 23 15 11 11 13
14 24 14 11 11 13

Tästä syystä osumat eivät aina sijoitu lähekkäin, jos niitä erottava mutaatio on tapahtunut alkupään markkereissa. Sen sijaan Esa Kannalan päivittämissä taulukoissa (N1c1, I1 ja R1b1a) suomalaiset on ryhmitelty enemmän todellisen läheisyyden (eli geneettisen etäisyyden) perusteella.
http://www.sukujutut.fi/dna/index.htm

TimoT
25.05.14, 16:07
Kiitos tiedosta. Huomasin, että yksi tutkimani nimi oli usean toisen nimisen ryhmän keskellä taulukossa. Siinä tosiaan on alkupään sarakeet samoja, mutta eroja tulee loppupäässä.

TimoT
11.06.14, 06:15
Mitä tuloksia on sitten SNP-alalehdellä YDNA-tuloksissa? Huomasin sieltä kaksi mielenkiintoista nimeä, joita ei näy classic-taulukoissa, mutta heillä on tuloksena täällä pelkkä viiva. Mitä tämmöinen tulos tarkoittaa? Näitä viivalla merkittyjä on paljon lehden alareunassa.

Jaska
11.06.14, 16:49
Mitä tuloksia on sitten SNP-alalehdellä YDNA-tuloksissa? Huomasin sieltä kaksi mielenkiintoista nimeä, joita ei näy classic-taulukoissa, mutta heillä on tuloksena täällä pelkkä viiva. Mitä tämmöinen tulos tarkoittaa? Näitä viivalla merkittyjä on paljon lehden alareunassa.
Käsittääkseni he ovat liittyneet projektiin mutta heidän testituloksensa ei ole vielä tullut. Tosin osa on notkunut siellä ilman haploryhmätietoa (ja ilman että on päätynyt haplotyyppilistaukseen eli "Y-results") jo vuosia, en tiedä miksi...

TimoT
15.08.15, 11:14
Osumalistalla olisi mielenkiintoisia tuloksia, mutta he eivät ole antaneet muuta tietoa kuin näytteenantajan nimen ja sähköpostiosoitteen, joka tuskin on näytteenantajan itsensä. Ei siis mitään tietoa esivanhemmista yms. Yhteydenottopyyntöön ei näytä tulevan vastausta. Onko kellään kokemusta, mitä tälläiset "haamuosumat" ovat?

ilkant
22.08.15, 22:33
Kysynpä tässä yhtä askarruttavaa asiaa. Onko sukututkimusohjelmissa tukea tälle DNA-sukututkimukselle? Esimerkiksi sellaisessa muodossa, että joku sukulaisuusside olisi "varmennettu" DNA:lla tms. Tai jotain muuta.

Olen ollut kiinnostunut DNA-testien teettämisestä. Mutta silloin kun asia tuli esille, oli muita kiireitä ja se jäi siihen. Nyt voisi vähän olla taas kiinnostusta.

Onko parempi, jos teettäjän lähisuvusta tai kauempaakin ei ole kukaan tehnyt DNA-testiä? Silloin voisi tulla "yllätyssukulaisia"? Vai tukeeko suvussa tehdyt tutkimukset sitten toisiaan eli näin päin parempi?

TimoT
23.08.15, 08:46
Minulla on kyllä osumissa omaa nimeäkin kantavia tuloksia, mutta hyvin kaukana. Lähimmät osumat ovat aivan muita, jopa pitkälle tutkittuja sukujakin noiden "haamuosumien" lisäksi, joiden ei luulisi olevan mitään sukua. Vähän tuntuisi siltä, että tämän menetelmän tarkkuus ulottuu korkeintaan heimotasolle. Sen lähempiä sukulaisia se tuskin tuo esille.

Maaret Eloranta
23.08.15, 12:00
Itse olen harrastanut perinteistä sukututkimusta kymmenisen vuotta ja nyt olen teettänyt DNA-testit sekä iseltäni että isältäni.
Olen käyttänyt FTDNA:ta Suomi-projektin kautta, enkä ole pettynyt tuloksiin. Keskustelufoorumi ja tulosten vertailu on antanut minulle erittäin paljon kiinnostavaa tietoa sukukenttäni kokonaisuudesta ja sen suhteesta Suomen asuttamiseen.
Isälinjaa ja äitilinjaa selvittävien haploryhmätestien lisäksi teetin FamilyFinder-testit, joilla analysoidaan yhteistä perimää laajemmalti.
Haploryhmätestien tulokset viittaavat minulla yhteykssin, jotka toistaiseksi ovat historiallisten asiakirjojen ulottumattomissa.
FF- tulosten kautta sen sijaan olen saanut paljon lisävalaistusta sekä äidin Savon puolen sukupusikkoon ja joitakin ilahduttava läheisiä geeniserkkuja isän puolelta Satakunnasta.
Ei harmita, vaikka rahaa paloi useita satasia.
Jokainen uusi testi antaa lisätietoa Suomen kokonaisperimästä, jos se liitetään projektiin ja tuloksia analysoidaan muihin vertaillen.
Päivitin myös Sukujutut-ohjelmani, jonka uudessa versiossa on paikka DNA- haploryhmälle. Ei huono!
Maare

ilkant
24.08.15, 00:57
Nyt olen jo ehtinyt tilaamaan Family Finder -paketin. Lähisukulainen ei ollut innostunut antamaan taloudellista tukea massiiviselle dna-tutkimukselle. Päätin lähteä itse omilla rahoillani alkuun pienestä ja varmasti jossain vaiheessa tilaan lisää testejä. Vaikuttaa ihan mielenkiintoiselta ja varmasti se on vielä enemmän sitä kun tulokset saapuvat.

Yksi jännä piirre on amerikkalaisissa palveluissa. Siellä on monessa paikassa sana buy, joka tarkoittaa rahanmenoa. Nyt kysynkin, mitä Family Tree DNA sivuston päivittämisestä (upgrade) saa hyötyä ja maksaako se? :)

Maaret Eloranta
24.08.15, 22:52
Nyt kysynkin, mitä Family Tree DNA sivuston päivittämisestä (upgrade) saa hyötyä ja maksaako se? :)

Upgrade toiminnolla ostetaan lisää testejä eli korotetaan panoksia. Itsekin ostin ensin halvemman mtDNA-testin ja korotin sen sitten täystestiksi. Samalla ostin FF-serkkutestin.
Kyllä siinä sitten sivut päivittyy, kun muutaman kuukauden kuluttua rupeaa ropisemaan geeniserkkuja listoille. Minulla niitä näkyy jo yli 1300, äiti kun on Savosta...
Pahin vika tuossa DNA-tutkailussa on sama kuin tässä sukututkimuksessa muutenkin. Menee yöt ihmetellessä...
Maare

Calonius
26.08.15, 11:27
Täälläkin on välillä vaikea ymmärtää, minkätyyppisestä testistä puhutaan milloinkin. Testin "tarkkuus" esimerkiksi riippuu siitä. Kyllä Y-DNA -testi todellakin näyttää läheiset osumat, jos joku läheinen sukulainen sellaisen testin tekee. Fakta on vain, että suoran isälinjan sukulaisia on vain pienen pieni murto-osa kaikista muista sukulaisista.

Huom! Esa Kannalan taulukot ovat päivitetty viimeksi kaksi ja puoli vuotta sitten.

Aslak67
08.11.15, 00:56
Kukin markkeri verrataan henkilöiden kohdalta erikseen. Jos esim. toisella on DYS393 14 ja toisella 13. Ero eli GD on 1. Näin käydään läpi kaikki markkerit ja saadut erot lasketaan yhteen.

Jos arvot ovat jossakin markkerissa esim. toisella 8 ja toisella 10, on ero silloin luonnollisesti 2 (ns. kahden askeleen hyppäys). Tämän voisi joku suurempi asiantuntija vielä vahvistaa, koska näissä useamman askeleen hyppäysten laskemisessa on muistaakseni eri laskentatapoja?

E viitsi puuttua keskusteluun, mutta nuo kahden askeleen hypyt ja mutaatiot taaksepäin voidaan eliminoida binäärisellä ohjelmalla tai laskutavalla.